危廢運輸主要有水路、公路、鐵路和航空等方式，公路運輸主要采用大罐車或油罐車，因為車廂多為橢圓結構，可以避免出現較大震動；水路運輸一般用于路途較遠且公路運輸存在一定安全隱患時，需要專業的運輸船體，以防危廢隨水源排入江河湖泊造成水域污染；鐵路運輸目前是按照當地環保部門的要求，由各站段聯系當地具有相應資格的企業進行處置，但由于站段產生的危廢品種多、數量多，并且涉及跨地區的車間，因此處理難度較大；航空運輸成本相對較高，一般針對具有特殊性的危險廢物，比如放射性危廢等；
不同的運輸方式有不同的特點，但就目前的情況來說，危廢運輸主要還是以公路為主。危廢運輸公司需要提前制定合理的運輸路線，比如根據城市規劃要求，危廢運輸路線不得穿越飲用水源保護區等。