對太陽能水泵的運行實施控制和調節，用太陽能陣列發出的電能驅動水泵，并根據日照強度的變化，實時地調節輸出頻率,使輸出功率接近太陽電池陣列的功率。

在不同系統中使用的驅動電機也不同。在小于10閱Np功率等級的光伏水泵系統中,為獲得盡可能高的系統效率,多采用直流無刷永磁電機驅動,在大型光伏水泵系統中,仍不乏采用交流異步傳動方式者,但是由于近代控制技術的不斷發展,為了進一步提高單位峰瓦提供的揚水量,己經開始有被多臺水泵實現柔性控制的多機群控技術所替代的趨勢。

水泵

對于光伏水泵系統而言,水泵類型的選擇同樣至為重要。在功率不大的系統中,若用戶要求揚程高但流量較小的情況下,宜選擇容積式正位移水泵,在其它情況下可能以采用離心式或軸流式水泵。關于光伏水泵系統配用泵型的選擇與考慮。