厭氧階段

發酵：兼性在沒有溶解氧和鹽氧的厭氧條件下，將溶解的BOD轉化為低分子量發酵產生的揮發性脂肪酸。

好氧階段

磷吸收：以磷積累的形式儲存超過生長所需的磷，并通過PHBPHV的氧化代謝產生能量，用于磷吸收和磷積累合成。能量以高能聚磷酸鹽鍵的形式富集和儲存，從液相中去除磷酸鹽，合成新的儲磷菌細胞，產生富磷污泥。

除磷系統

剩余污泥排放：通過剩余污泥排放將磷從系統中去除。

好氧磷吸收的前提是混合物必須通過厭氧過程釋放。在有效釋放磷的過程中，厭氧釋放磷可以大大提高微生物的好氧磷吸收能力。

磷作為活性污泥微生物正常生長所需的元素，也成為生物污泥的一個組成部分，需要去除。

活性污泥的磷含量一般在干重的1.5%～2.3%之間，通過剩余污泥的排放可以達到10%～30%的除磷效率。

除磷效率主要取決于進水BODTP比、污泥齡、污泥處理方式和處理液回流等。

典型的生物除磷工藝、氧化溝工藝等。除AO工藝外，其它工藝均具有同步脫氮除磷的能力。